发布时间:2015-07-23 14: 24: 22
SMD File(Standard Molecular Data File)格式文件是ChemDraw支持的众多化学格式文件之一,ChemDraw可以利用自身的文件解释程序来支持多种格式的ChemDraw文档解释。本次内容将以Cyclohexanol结构为实例为您条分缕析ChemDraw支持的MD File格式文件的内容。
Cyclohexanol结构即为环己醇,是无色透明油状液体或白色针状结晶,有似樟脑丸气味。并且可微溶于水,混溶于乙醇、乙酸、乙酯、乙醚、二硫化碳和油类。ChemDraw解释Cyclohexanol(环己醇)的数标如下所示:
一、SMD File格式文件下的Cyclohexanol结构
line 1 > STRT cyclohexan
line 2 > DTCR ChemDraw
line 3 > CT 0 03-MAR-92 12:23:58
line 4 15
line 5 7 7(A2,5I2)(2I4,4I2)
line 6 C
line 7 C
line 8 C
line 9 C
line 10 C
line 11 C
line 12 O
line 13 1 2 1
line 14 2 3 1
line 15 3 4 1
line 16 4 5 1
line 17 5 6 1
line 18 1 6 1
line 19 6 7 1
line 20 > CO Points 8
line 21 2(2I8)
line 22 24040 2700
line 23 24040 900
line 24 25600 0
line 25 27160 900
line 26 27160 2700
line 27 25600 3600
line 28 28715 3600
line 29 > LB 2
line 30 1(I3,X,A)
line 31 7: OH
【注意】行数只是为了方便说明而添加的。
二、ChemDraw解释SMD File格式文件下的Cyclohexanol结构
每一行既表示间隔行、模块标头行又表示一个含有多个关于结构信息符号组的数据记录。SMD File格式文件被分为几个信息模块,每个模块的标头前用“>”标记开始。独立的各符号组是由空格来限制的。解释ChemDraw 支持的SMD File格式文件中符号组信息如下:
1、line 1 名为STRT模块。此模块含有分子名称,当文件用ChemDraw建立时,分子名称也是文件名称。
2、line 2 名为DTCR模块。此行含有的信息包括应用软件的名称——ChemDraw,以及ChemDraw建立的文件、日期和时间。
3、line 3 名为CT模块。同时指示含在模块中记录的数(体现在line 4 中的15),此模块中的信息包括Connection Table 格式的化学结构。
4、line 5 包含4个符号组:含2个符号组。第一组是从Cartesian直角坐标转换到实际直角坐标系的比例系数,第二组是FORTRAN格式的原子坐标。
5、line 6~12 每行含一个描述原子类型的符号。原子类型可由一个元素组成,整个的原子标记在这里并不表示出来,只给出原子标记中的第一个原子。
6、line 13~19 属于CT模块,每行含3个描述连接原子的键的符号组。第一组是键开始端的原子的系列数(1),第二组是键端的系列数(6),第三组是键的级数(1)。
7、line 20 名为CO模块。指示了用在图形中的单位(此实例中是点)和在此模块中的行数(此实例中是8)。在此模块中的信息包括Cartesian直角坐标,该坐标为右手Cartesian坐标系统。
8、line21 含两个符号组。第一组是从Cartesian直角坐标转换到实际坐标系的比例系数,第二组是FORTRAN格式的原子坐标。
9、line22~28 每行含在CT模块中的每个原子的Cartesian直角坐标。
10、line 29 名为LB模块。同时指示含在模块中记录的数(此实例中是2)。
11、line 30 含有两个符号组,第一组是有完全原子标记的原子的数目,第二组是FORTRAN格式的有完全原子标记的原子的数目。
12、line 31 含有两个符号组,描述了在结构中任何未分析的完整的原子标记。第一组是未分析的原子标记的系列数目(7),第二组是完全的原子标记(OH)。
以上就是有关SMD File格式的ChemDraw文档的内容,希望能有助于您理解ChemDraw是如何解释SMD File格式文件。若想了解更多ChemDraw支持的化学格式文件的学习内容请点击实例讲解ChemDraw支持的Connection Table 文件。
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